Référence CSP: UAR3601-ANILEF-031 Missions : Contribuer aux développements de l'application de courtage de données, qui vise à collecter, gérer, analyser et diffuser des données et des métadonnées vers les entrepôts internationaux type ENA ; Interagir avec les projets nationaux en cours qui incluent des besoins en data brokering au sein des plateformes & équipes de l'infrastructure IFB. Activités : Concevoir et développer la base de données Optimiser le requêtage sur la base de données Mettre en place des processus automatiques de traitement de données sur une VM ou sur le cluster de calcul de l'IFB Mettre en place des connecteurs entre l'outil de courtage et des outils d'analyse, traitement, . (par exemple Galaxy) Concevoir et développer des interfaces utilisateurs (GUI) et d'interfaces programmatiques (API) Optimiser les APIs déjà existantes Concevoir et développer des outils extérieurs facilitant l'analyse de données (par exemple en participant aux développements d'un package R) Participer à des réunions avec les partenaires et les différents groupes de travail pour assurer l'adéquation de l'outil avec les besoins des usagers Rédiger, en français et en anglais, la documentation pour les usagers, les administrateurs et les développeurs Assurer une veille technologique Participer à l'assistance et au support utilisateur. Contexte de travail : L'Institut Français de Bioinformatique (IFB ; france-bioinformatique.fr) est une infrastructure nationale qui regroupe 35 plateformes et équipes de recherche en bioinformatique, et une unité coordinatrice, IFB-Core (UAR 3601). L'IFB déploie sur l'ensemble du territoire national des services en bioinformatique: infrastructure de calcul, logiciels et bases de données, analyse des données biologiques, gestion des données, formations. Le projet Mutualized Digital Spaces for FAIR Life and Health Sciences (MUDIS4LS, PIA3 ESR/Equipex+) finance l'équipement de l'ensemble du réseau national de ressources computationnelles (NNCR) de l'IFB, et des développements innovants pour faciliter la gestion des données, et l'appui aux communautés des sciences du vivant (microbiologie, santé, agronomie, environnement). MUDIS4LS inclut notamment un outil permettant de faciliter le flux des données, Madbot (Metadata And Data Brokering Online Tool), une application web qui fournit un tableau de bord pour la gestion des données et des métadonnées de recherche. Sa philosophie est d'agréger des métadonnées autour de projets scientifiques en créant des liens, par le biais de connecteurs, vers l'endroit où les données sont stockées sans stocker les ensembles de données en tant que tels. Ces connecteurs rendent Madbot très flexible et adaptable à de nombreux environnements de recherche. Il s'interface déjà avec de nombreux outils de gestion et d'analyse de données utilisés quotidiennement par les chercheurs, tels que les carnets de laboratoire électroniques (Labguru, eLabFTW), les systèmes de stockage de fichie Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...