Mission : Nous recrutons une ingénieure / un ingénieur en bioinformatique pour travailler sur un projet mêlant biologie du développement et cancérologie pédiatrique. La principale mission consistera à analyser de nouvelles données single-nuclei RNA-seq générées à partir d'un modèle de transplantation in vivo de cellules tumorales humaines dans leur territoire d'émergence au sein d'un embryon aviaire (Delloye-Bourgeois et al., Cancer Cell, 2017 ; Villalard et al., Nat Commun, 2024) Activités : • Analyse et traitement des données single-nuclei RNA-seq. • Comparaison des résultats obtenus avec des données de patients publiques ou des nouvelles données issues de collaborations. • Application de méthodes bio-informatiques pour l'annotation cellulaire, l'identification de sous-populations, l'analyse des trajectoires développementales, de communication cellulaire, d'enrichissement en processus biologiques etc. • Collaboration étroite avec les biologistes de l'équipe pour interpréter les résultats et orienter les analyses ainsi qu'avec les autres bioinformaticiens ou bioinformaticiennes de l'équipe ou d'équipe collaboratrice • Développement de pipelines pour automatiser le traitement des données et assurer leur reproductibilité. • Visualisation et présentation des résultats sous forme de rapports et de figures scientifiques.