Description : Pour ce contrat de travail d'une durée de 12 MOIS RENOUVELABLE, la personne recrutée rejoindra l’équipe « Oncogénèse des sarcomes » dirigée par Frédéric CHIBON. L’équipe cherche à comprendre les mécanismes chromosomiques de l’oncogenèse des sarcomes pléomorphes, caractérisés par une très grande instabilité chromosomique. Mission principale La personne recrutée aura pour missions : · D’analyser les données de variants structuraux identifiés par RNAseq sur les données du TCGA · D’Evaluer la pertinence du marqueur biologique iTRAC pour l’analyse pronostique et prédictive de la réponse au traitement systémique dans les différents types de cancers analysés par le TCGA Activités principales · Développer et appliquer des scripts R · Développer et appaliquer des pipeline d’analyse sur le cluster decalcul du Genotoul · Mettre à jour le GitHub de l’équipe. Spécificité(s) et environnement du poste · Travail sur écran Profil recherché : Connaissances · Connaitre la biologie des sarcomes · Connaitre les mécanismes chromosomiques de l’oncogenèse. · Maitriser les statistiques adaptées à ce type d’analyse · Maitriser le langage R · Maitriser le calcule parallélisé sur cluster Savoir-faire · Mener de A à Z un projet d’analyse bioinfomatique · Produire des figures de synthèse adaptées aux messages identifiés. · Ecrire les articles scientifiques présentant les résultats obtenus. Aptitudes · Rigueur scientifique · Esprit critique · Esprit d’initiative Expérience(s) souhaitée(s) · Une expérience en ananlyse bioinformatique de données génomiques tumorales sera appréciée Niveau de diplôme et formation(s) · Bac + 5 Minimum · Souhaité dans le domaine de l’oncogenèse