Descriptif du poste:\n\nVos missions:\n-Concevoir, mettre en place et maintenir des pipelines bioinformatiques automatisés ;\n-Automatiser, sécuriser et industrialiser les workflows afin de permettre leur passage à l'échelle (scale-up) ;\n-Développer et optimiser les pipelines à l'aide de systèmes de gestion de workflows tels que Snakemake ou Nextflow ;\n-Identifier et sélectionner les outils bioinformatiques les plus adaptés aux différents besoins d'analyse ;\n-Optimiser leur implémentation afin de garantir de bonnes performances en termes de ressources et de temps de calcul ;\n-Développer et maintenir les différents scripts nécessaires, notamment en Python ;\n-Déployer et exécuter les analyses dans un environnement Cloud, notamment AWS ;\n-Assurer la gestion des environnements et la conteneurisation des applications à l'aide de Conda et Docker ;\n-Garantir la documentation, la traçabilité et le versioning du code avec Git ;\n-Contribuer plus largement à l'amélioration de la reproductibilité et de l'efficience des analyses bioinformatiques.\n\nProfil recherché:\n\nVotre profil:\nDe formation supérieure en bioinformatique, informatique, biologie computationnelle ou domaine scientifique équivalent, vous disposez d'une expérience vous ayant permis de développer de solides compétences en développement et automatisation de workflows bioinformatiques.\nVous maîtrisez ou avez une bonne connaissance des environnements et technologies suivants :\nPython - Snakemake et/ou Nextflow - Git - Docker - Conda - Cloud / AWS\nAu-delà des compétences techniques, nous recherchons une personne capable de travailler avec rigueur sur des problématiques d'automatisation, de reproductibilité et d'optimisation des analyses.