Mission : L'approche One Health est reconnue comme la méthode la plus pertinente pour étudier la dissémination de l'antibiorésistance qui atteint des niveaux très préoccupants. L'offre d'emploi proposée s'inscrit dans le projet AntiobioOne, financé par l'Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), dont le but est d'étudier le devenir de l'antibiorésistance et les communautés microbiennes dans une zone humide artificielle de grande taille recevant les eaux usées traitées d'une grande agglomération française et chez la faune sauvage y résidant. Le LCPME travaille sur ce site depuis quelques années avec plusieurs partenaires des domaines médical, vétérinaire ou scientifique. La personne recrutée rejoindra l'équipe de Microbiologie Environnementale (MIC) du LCPME pour tout d'abord rechercher, dans les eaux et les fèces d'animaux sauvages collectées, la présence de gènes d'antibiorésistance et d'éléments génétiques mobiles vecteurs d'antibiorésistance en collaboration avec les partenaires du projet. Ces données seront comparées à celles obtenues avec des échantillons collectés dans une zone naturelle protégée à proximité du site d'étude. La personne recrutée sera également impliquée dans des expériences menées au LCPME avec des bioréacteurs permettant d'étudier plusieurs mécanismes de transferts horizontaux d'éléments génétiques mobiles vecteurs d'antibiorésistance par des méthodes de biologie moléculaire. Activités : Activités principales : - Participation aux campagnes de terrain mensuelles pour collecter les échantillons d'eaux et de fèces - Extraction d'ADN de communautés microbiennes environnementales (bactéries, phages et ADN dissouts) - Expérimentation en bioréacteurs pour le suivi de transferts horizontaux d'éléments génétiques mobiles - Séquençage par approche long-read et analyse bio-informatique des séquences obtenues - Envois réguliers d'échantillons ou d'extraits d'ADN aux partenaires du projet - Enregistrement et présentation des résultats, réalisation de rapports Activités complémentaires : - Appliquer les règles d'hygiène et de sécurité correspondantes aux situations de travail - Gérer et organiser les stocks de matériel du laboratoire (inventaire, préparation des commandes, rangement) liés au projet