Vous effectuerez les missions suivantes : -       Traiter les données d'échantillons générées par les programmes cliniques de l'Institut. -       Fournir des résultats et apporter une expertise en contrôle qualité (QC) et interprétation des résultats aux équipes cliniques. -       Gérer un ensemble de pipelines de traitement de données multiomiques validés. -       Développer des stratégies d'automatisation pour un traitement efficace des échantillons au sein de la plateforme d'analyse. -       Contribuer au développement et à l'exécution d'un système de suivi du traitement et de l'analyse des données. -       Concevoir et mettre en oeuvre des méthodes innovantes pour la restitution des résultats, afin d'aider les équipes cliniques dans leurs recherches. -       Assurer la qualité des résultats sur l'ensemble de la plateforme. -       Appliquer les dernières technologies et méthodologies pour garantir la pleine reproductibilité du traitement des données au sein de la plateforme d'analyse. -       Valider et mettre en place de nouvelles étapes d'analyse et de traitement des données en collaboration avec l'équipe de développement de pipelines de la core facility bio-informatique et les groupes de recherche bio-informatique. -       Collaborer étroitement avec l'équipe de gestion des données pour développer des stratégies de stockage et d'archivage des résultats. -       Contribuer à la mise en place d'une infrastructure de gestion des métadonnées. -       Assurer sa formation continue en restant informé(e) des évolutions dans les communautés bio-informatique et de recherche. -       Participer aux réunions, ateliers et séminaires de Gustave Roussy. -       Contribuer à des publications scientifiques si nécessaire. Le(La) candidat(e) devra incarner les valeurs suivantes : ouverture, dynamisme et esprit collégial, et présenter le profil suivant : Qualifications, expériences et compétences essentielles : -      Diplôme dans une discipline pertinente avec une forte composante analytique (bio-informatique, statistiques, biologie moléculaire, mathématiques, ou équivalent). -      Excellentes compétences en programmation dans un langage adapté (p. ex. Python, Java, R). -      Excellentes compétences sur Linux et HPC. -      Expérience dans l'exécution et le développement de pipelines bio-informatiques avec un système de gestion de workflows (p. ex. Nextflow, Snakemake). -      Bonne compréhension des logiciels de traitement de données de séquençage haut-débit et des outils de traitement bio-informatique. -      Compréhension des données multi-omiques et des approches d'analyse associées. -      Compréhension des logiciels de reporting (p. ex. quarto, markdown). -      Connaissance des technologies assurant la reproductibilité du traitement des données (conteneurs, environnements, logiciels de gestion des changements). -      Compréhension des processus et de la gestion du développement logiciel. -      Capacité à organiser et prioriser la charge de travail. -      Excellentes compétences en communication scientifique dans un environnement de recherche Qualifications, expériences et compétences souhaitées : -      Connaissance de la biologie du cancer. -      Connaissance de l'application de techniques statistiques aux données biologiques. -      Connaissance des protocoles de génération de données omiques. -      Familiarité avec la visualisation des résultats d'analyse omiques. -      Connaissance des bases de données relationnelles.