Mission : L'ingénieur d'études aura pour mission de participer à la construction d'un flux de données complet à partir de l'acquisition automatisée d'images de phytoplancton marin par des cytomètres en flux automatisés de terrain et de laboratoire, la conversion des fichiers acquis dans le format adéquat pour l'import des images en vue d'une classification automatisée du phytoplancton marin. La personne devra également assurer l'envoi de ces données sur des bases de données open access. Activités : - Tester et poursuivre le flux de travail débuté depuis la conversion des fichiers d'imageurs haut débit et du cytomètre en flux automatisé vers l'import des images sur une plateforme dédiée (EcoTaxa) - Etudier comment rendre la donnée quantitative (en plus de qualitative uniquement présence/absence) - Participer au flux de travail pour envoi des données issues de la plateforme vers des bases de données européennes (EMODnet) en adhérant au standard taxonomiques (Darwin Core) et en utilisant un vocabulaire contrôlé - Participer au développement et implémentation des cas d'usage (DUC) dans le but de démontrer les bénéfices d'une approche intégrale pour la surveillance de la biodiversité marine