Le bioinformaticien que nous recherchons possède une grande expertise en biologie computationnelle, en analyse de données et en outils logiciels permettant d'interpréter des données biologiques complexes. Son rôle consiste à collaborer avec des scientifiques, des ingénieurs, des techniciens et des chercheurs afin de développer des pipelines, d'analyser des ensembles de données à haut débit et de générer des connaissances qui favorisent les découvertes scientifiques et l'innovation. En travaillant chez Neoplants, le / la bioinformaticien.ne a l'opportunité unique de participer à des recherches de pointe et à des projets ambitieux qui peuvent littéralement changer le monde, au sein d'une équipe collaborative, interdisciplinaire et très engagée. Mission principale (liste non exhaustive) : - Concevoir, mettre en œuvre, optimiser et maintenir des flux de travail et des pipelines bioinformatiques pour les données à haut débit et analyser des ensembles de données à grande échelle. - Analyser et intégrer des ensembles de données multi-omiques pour soutenir la R&D, le développement de produits et la conception expérimentale. - Prototyper et tester rapidement des approches computationnelles pour relever de nouveaux défis scientifiques. - Collaborer avec des équipes interfonctionnelles pour traduire les données brutes en connaissances biologiques et en outils d'aide à la décision. - Évaluer et mettre en œuvre les nouveaux outils, méthodes et technologies bioinformatiques. - Documenter les flux de travail et communiquer clairement les résultats aux parties prenantes techniques et non techniques. - Contribuer à la propriété intellectuelle, aux publications, aux présentations à mesure que l'entreprise se développe et aux demandes de subventions, le cas échéant. - Se tenir au courant des nouveaux outils, méthodes et technologies bioinformatiques. Expérience requise : - Maîtrise ou doctorat en bio-informatique, biologie computationnelle, informatique, statistiques ou dans un domaine connexe (ou expérience professionnelle équivalente). - Solides compétences en programmation dans des langages tels que Python, R ou Perl. - Maîtrise des outils, bases de données et plateformes bioinformatiques (par exemple, NCBI, Ensembl, UCSC Genome Browser, BLAST, GATK). - Expérience avec les données de séquençage à haut débit (par exemple, RNA-seq, WGS, WES, scRNA-seq). - Maîtrise du machine learning, de la modélisation statistique ou de la visualisation de données est un plus. - Solides compétences en résolution de problèmes et capacité à travailler de manière autonome et collaborative. - Excellentes compétences en communication écrite et orale. - Rigueur scientifique extrême et souci du détail. - Capacité à travailler de manière autonome avec peu ou pas de supervision. - Esprit d'équipe, bonnes compétences interpersonnelles et communicationnelles. - Maîtrise de l'anglais (oral et écrit) Atouts supplémentaires : - Expérience dans les environnements de cloud computing (AWS, GCP ou Azure). - Connaissance des systèmes de gestion des flux de travail (par exemple, Snakemake, Nextflow, CWL). - Formation en biologie moléculaire, génétique ou recherche biomédicale. - Connaissance du contrôle de version (Git/GitHub) et des pratiques de codage collaboratif.