Chercheur en écologie microbienne des systèmes marins exploités (H/F) 988 - Nouméa
Offre n° 2202049
Chercheur en écologie microbienne des systèmes marins exploités (H/F)
988 - Nouméa - Localiser avec Mappy
Publié le 01 mai 2026
Date de clôture des candidatures : 28/05/2026 Qui sommes-nous ? Depuis janvier 2020, l'unité LEAD-NC (Lagon, Ecosystèmes et Aquaculture Durable en Nouvelle-Calédonie) est membre de l'UMR Entropie (Écologie Marine Tropicale des océans Pacifique et Indien) dont l'objectif général est d'étudier la biodiversité et les ressources marines et littorales de la grande région Indo-Pacifique tropicale. Nos travaux visent à comprendre la dynamique et la vulnérabilité de cette biodiversité face aux forçages environnementaux naturels et anthropiques et à développer des outils de conservation et de valorisation durable des ressources, d'aide à la gestion et à la gouvernance. Les travaux de l'unité Ifremer LEAD se concentrent plus particulièrement sur la caractérisation et la compréhension de la dynamique des écosystèmes lagonaires et des agrosystèmes, leur état de santé, à différentes échelles (de l'écosystème à l'organisme) selon trois axes i) la dynamique des forçages environnementaux lors d'épisodes intenses (eg. Canicules marines, dépressions tropicales), ii) la diversité et structure microbienne environnementale le long du continuum terre-mer en prenant en compte les agrosystèmes iii) la réponse de l'holobionte (limites physiologiques d'organismes d'intérêt écologique ou aquacole, plasticité phénotypique.) face à ces forçages. Le poste est placé sous l'autorité du Responsable de l'Unité LEAD NC / Délégué Ifremer en Nouvelle-Calédonie. Il est positionné sur le centre IRD de Nouméa. Vous mènerez des activités de recherche et d'expertise répondant à l'enjeu « Diversité, structure et rôle du microbiome dans les écosystèmes marins » de l'UMR Entropie dont vous porterez le rôle de coanimateur(trice) de cet enjeu, comprenant également les systèmes d'élevage aquacole. Vous favoriserez une approche intégrée en lien étroit avec les autres chercheurs du LEAD-NC et d'Entropie dans un contexte de changement global et de pressions anthropiques. Quelles sera votre mission ? Vous mènerez des activités de recherche s'inscrivant dans les différents projets en cours au sein de l'unité en interaction étroite avec les autres cadres de recherche de l'unité : - Étude de la dynamique et de la structure du microbiome par des approches OMICs, intégrant les différents phyla (bactéries, archées, protistes, micro algues et virus), dans les systèmes d'élevage et dans les écosystèmes lagonaires, dans un contexte de changement climatique et de pressions anthropiques ; - Étude de la dynamique et de la structure du microbiome en relation avec des phénotypes de réponses contrastées (mortalités, accumulation métaux, polluants.) sur des espèces marines d'intérêt économique et/ou écologique (étude de l'holobionte) ; - Caractérisation écologique d'espèces de microorganismes potentiellement néfastes et/ou toxiques dans les écosystèmes lagonaires et agrosystèmes (vibrio, algues toxiques.) ; - En particulier sur le modèle de crevette exploité (Penaeus stylirostris) : étude d'une potentielle gestion des communautés microbiennes en élevage afin d'optimiser les performances d'élevage, dans un contexte de suppression des antibiotiques en écloserie; et évaluation de l'impact de nouvelles pratiques zootechniques (utilisation de nouveaux ingrédients pour la nutrition animale telles que les farines d'insectes, ou de probiotiques) sur leur microbiome et l'état physiologique des crevettes ; Pour répondre à ces questions, les travaux conduits s'intéresseront principalement à deux composantes du compartiment microbien : la diversité et structure des procaryotes et les producteurs primaires en interaction étroite avec le cadre de recherche s'intéressant à l'écophysiologie des microalgues (toxiques et non toxiques). Vous participerez à la réflexion pour la mise en place de nouvelles infrastructures expérimentales en biologie marine. Au sein de l'UMR Entropie, vous serez en charge de la coanimation scientifique de l'enjeu « Diversité, structure et rôle du microbiome dans les écosystèmes marins » en collaboration avec un autre membre de l'UMR basé à la Réunion. Quelles seront vos activités ? Vous aurez pour principales activités : - Définition et mise en œuvre des actions de recherche sur l'écologie microbienne (dynamique et fonctionnelle) des systèmes d'élevage et du milieu « naturel » environnant en lien étroit avec les autres chercheurs de l'UR et de l'UMR Entropie ; - Développement des partenariats scientifiques et techniques avec les organismes partenaires, localement, régionalement ou avec les unités de métropole ; - Montage et financement de projets de recherche collaboratifs ; - Participation à la formation par la recherche (encadrement étudiants, thèse). - Valorisation des résultats
- Type de contrat
-
CDI
Contrat travail
Profil souhaité
Expérience
- Expérience exigéeCette expérience est indispensable
Informations complémentaires
- Qualification : Cadre
Employeur
Ifremer
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