POSTE : Thèse de Doctorat Évolution de la Diversité des Cyanobactéries et du Profil Toxinogène au Sein d'Une Filière de Potabilisation de la Ressource à l'Ea. DESCRIPTION : Évolution de la diversité des cyanobactéries et du profil toxinogène au sein d'une filière de potabilisation : de la ressource à l'eau produite Les cyanobactéries représentent un enjeu sanitaire croissant pour la production d'eau potable, notamment en raison de l'intensification des blooms liée au changement climatique et à l'eutrophisation des bassins versants. Ces micro-organismes produisent des cyanotoxines dont les effets sur la santé humaine peuvent être graves. Ce projet doctoral propose une approche intégrée pour caractériser la diversité des cyanobactéries et leurs profils toxinogènes tout au long de la filière de potabilisation, depuis la ressource jusqu'à l'eau traitée. Les axes de recherche combinent des méthodes de séquençage (amplicon 16S, métagénomique) et de bioinformatique, la détection de gènes de biosynthèse de toxines par qPCR ou dPCR, des expérimentations sur l'effet des spectres lumineux UV sur la lyse et la photo-réparation des cyanobactéries, ainsi que la modélisation du risque sanitaire par approche QMRA. Les livrables attendus incluent une cartographie de la diversité cyanobactérienne, des bilans d'élimination sur filières réelles et des recommandations opérationnelles pour les exploitants. Missions du doctorant Le ou la doctorant(e) interviendra sur deux sites partenaires complémentaires : le laboratoire d'Eau de Paris (Ivry sur Seine) et le Muséum National d'Histoire Naturelle de Paris (MNHN), le candidat bénéficiant d'une codirection de la thèse permettant une formation à la fois universitaire et industrielle. Ses missions s'articuleront autour de quatre axes principaux : - Surveillance : à partir de prélèvements réguliers tout au long de la filière de potabilisation (ressource, étapes intermédiaires, eau produite) selon un calendrier saisonnier, afin de capturer la dynamique temporelle des communautés cyanobactériennes. - Analyses moléculaires et bioinformatiques : mise en oeuvre de protocoles de séquençage et traitement bioinformatique des données NGS, recherche de gènes de biosynthèse de toxines. - Expérimentations en conditions contrôlées : conduite d'expériences sur souches de collection et isolats primaires afin d'étudier l'effet de différents spectres lumineux sur la croissance et la production de toxines des cyanobactéries. - Modélisation et valorisation : construction de scénarios de risque sanitaire par approche QMRA à partir des données de concentration en toxines, rédaction d'articles scientifiques et contribution à l'élaboration de recommandations opérationnelles destinées aux exploitants d'usines de potabilisation. PROFIL : Profil idéal du candidat Le ou la candidat(e) recherché(e) est titulaire d'un Master 2 en microbiologie environnementale, écologie microbienne, biologie moléculaire ou en sciences de l'eau. Une solide maîtrise des techniques de biologie moléculaire (PCR quantitative et/ou digitale, séquençage haut débit) et une appétence pour la bioinformatique (analyse de données de métagénomique, traitement de données NGS) et une connaissance du l'interface R sont indispensables. Une sensibilité aux enjeux de santé publique liés à la qualité de l'eau, ainsi qu'une capacité à travailler en interface entre laboratoire et terrain, seront fortement valorisées. Des compétences pour la modélisation du risque microbiologique (QMRA) constitueront un atout supplémentaire. Le projet requiert également de la rigueur scientifique, un sens de l'autonomie, une aptitude à travailler en équipe et une bonne capacité de communication écrite en français et en anglais pour la valorisation des résultats dans des revues internationales et des congrès. Ref: xvcjerjv83