Référence CSP: 2025-2050658 La conception d'outils d'aide à la décision (OAD) pour les gestionnaires de la santé animale est un enjeu majeur tant pour la valorisation des recherches interdisciplinaires menées en épidémiologie prédictive que pour une meilleure gestion des maladies infectieuses en élevage et des risques de santé publique vétérinaire associés. Spécialisée en modélisation épidémiologique, l'équipe DYNAMO a développé une nouvelle approche de modélisation générique (EMULSION), s'appuyant sur des méthodes d'Intelligence Artificielle (IA). Ces méthodes facilitent largement la co-construction de modèles épidémiologiques entre modélisateurs, scientifiques d'autres disciplines, et gestionnaires de la santé, et simplifient la révision et le maintien des codes. En outre, une chaîne logicielle (PASTE) a été développée pour automatiser la production d'OAD à partir des modèles développés via EMULSION. Un OAD a été developpé en particulier dans le cadre du projet Européen DECIDE (2021-2026) de façon à fournir régulièrement des recommandations pour la gestion de la santé en élevage à partir d'une détection précoce des troubles respiratoires au moyen de capteurs. Au sein de l'équipe DYNAMO et en collaboration avec les partenaires du projet, vous contribuerez à adapter et finaliser la chaîne logicielle permettant l'automatisation de la génération de cet OAD dans un cadre générique, afin de permettre son utilisation pour la gestion d'autres maladies. Vous contribuerez également à réviser et à optimiser l'architecture de simulation d'EMULSION pour réduire le coût computationnel des scénarios et l'intégrer dans un nouvel outil connecté à un système d'information de capteurs. Environnement technique - Python 3 - Langages de templates (JinJa2,...) - Linux (principalement Debian, Ubuntu) - HTML5, Django - PostgreSQL - git - YAML - R, ggplot, RShiny - Architecture logicielle - Tests - Docker