[53724] CHU DE MONTPELLIER Grade Grille de référence I.H. Type de contrat Contractuels acceptés Pourcentage d'activité 100% DÉFINITION : Immun4Cure (I4C) est institut hospitalo-universitaire (IHU) dont l'objectif est de développer de nouvelles thérapies innovantes afin de lutter contre les maladies auto-immunes. Ce projet ambitieux repose tout d'abord sur un volet clinique important comprenant différentes cohortes de patients associées à différentes maladies auto-immunes comme le lupus, l'arthrite rhumatismale ou la sclérodermie. Par ailleurs, I4C fonde aussi son effort sur de la recherche fondamentale autour de l'auto-immunité centrée sur les pathologies visées en clinique. Les travaux de recherche tant fondamentaux qu'auprès des patients impliquent des technologies de génomique à haut débit et donc des données volumineuses et complexes. Ces données seront acquises selon des modalités diverses : transcriptomique, protéomique, séquençage de l'ADN, imagerie. Les technologies utilisées seront-elles aussi diverses et parmi les plus avancées : cellules uniques, biologie spatiale, images, séquençage Illumina mais aussi en long reads, etc Horaires : 9h-18h Repos : samedi-dimanche ACTIVITÉS PRINCIPALES :  Développement de scripts implémentant les pipelines génomique et transcriptomique  Gestion des versions de ces scripts.  Développement des progiciels et programmation nécessaires à l'exploitation des données biologiques et médicales  Formation de personnes aux techniques et procédures de son domaine, et à leur application  Paramétrage des outils, logiciels, systèmes relevant de son domaine d'activité  Participation aux publications scientifiques et médicales en interne ou externe  Traitement et analyse de l'information/données médicale et/ou biologique : extraction, regroupement, représentation graphique  Veille professionnelle ACTIVITÉS SPÉCIFIQUES LIÉES AU POSTE :  Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, brevets, publications, présentations orales.  Analyse des données OMICS (génomique et transcriptomique) CORRESPONDANCE STATUTAIRE (grade) :  Ingénieur hospitalier  Catégorie A Description du profil recherché: SAVOIR ETRE REQUIS :  Méthode et rigueur  Motivation  Esprit d'équipe  Adaptabilité  Organisation  Autonomie  Précision  Dynamisme  Esprit d'initiative  Sens du relationnel PRÉREQUIS INDISPENSABLES :  Une intégration parfaite et aussi indispensable avec le ou la gestionnaire du système de base de données relationnel.  Une bonne culture générale en bio-informatique avec l'expérience de plusieurs types de données.  BAC + 5 PRÉREQUIS SOUHAITÉS :  Méthodes agiles  Familiarité avec un système de développement de workflow bio-informatique, par exemple Nextflow  Une expérience préalable dans un environnement de production PARTICULARITÉS DU POSTE :  Forte interaction attendue avec les bio-informaticiens spécialistes des différents types de données qui apporteront aide et conseils  Programmation en Python, requêtes SQL et bases de données Horaires : Horaires normaux