Descriptif du poste: Rattachée à l'unité Ecologie et Evolution de la Résistance aux Antibiotiques, la personne recrutée interviendra dans le projet ANR PARTHAGE coordonné par Lulla Opatowski de l'Institut Pasteur. L'objectif de PARTHAGE est de comprendre, par la modélisation, les facteurs contribuant à la dissémination et à la transmission de souches d'entérobactéries multirésistantes dans des structures hospitalières. Le projet PARTHAGE implique des équipes de cliniciens des hôpitaux de Caen, Avicenne et Garches (APHP). Missions : Dans ce contexte, la mission principale de la personne recrutée sera de : - Réaliser des analyses génomique et métagénomique sur des échantillons cliniques afin de quantifier la contribution du microbiome digestif dans l'acquisition de souches multirésistantes. - Une mission secondaire sera l'analyse des facteurs contribuant à la transmission des plasmides et à leur stabilité. La personne recrutée sera formée à l'analyse bio-informatique des données générées. Profil recherché: Profil .Niveau M2 ou équivalent en microbiologie / bactériologie. .Expérience attendue en biologie moléculaire (PCR, PCR quantitative, clonage, séquençage d'ADN) et en bactériologie. .Une connaissance de la résistance aux antibiotiques est un plus tout comme une expérience en analyse métagénomique. .Des compétences en bio-informatiques ne sont pas nécessaires. Il est néanmoins important de savoir analyser les séquences d'ADN et de protéine. Vos conditions et environnement de travail : .CDD 15 mois .Statut cadre, Forfait jours .Forfait mobilité douce ou remboursement de 75% des titres de transport .Cantine d'entreprise, restaurants, cafétérias .Mutuelle familiale (gratuité conjoints/enfants) et service de santé pour les collaborateurs sur le campus .Salles de sports, 30 activités culturelles/artistiques/sportives sur le campus .Engagements RSE forts, et initiatives des collaborateurs encouragées .Environnement multiculturel (plus de 75 nationalités sur le campus)