Ingénieur Bioinformaticien en analyse de données omiques F/H - Système, réseaux, données (H/F) 91 - ORSAY
Offre n° 4502820
Ingénieur Bioinformaticien en analyse de données omiques F/H - Système, réseaux, données (H/F)
91 - ORSAY - Localiser avec Mappy
Publié le 02 avril 2025
Descriptif du poste: Missions du service : La personne recrutée soutiendra l'activité des chercheurs·es et étudiants·es bioinformaticiens·nes dans les équipes « Bio-Informatique Moléculaire » (BIM) et « Séquence, Structure et Fonction des ARN » (SSFA) de l'I2BC. Elle participera aux projets de recherche et à la conception et au développement de logiciels d'analyse, de bases de données et interfaces utilisateurs·rices, dans le domaine de la génomique et de données haut-débit (transcriptomique, traductomique.). Elle sera sous la responsabilité hiérarchique d'un des deux responsables d'équipe. Activités principales de l'agent·e : * Mettre en place et participer à des projets d'analyse/fouille de données de séquences à haut débit (génome/transcriptome/traductome/protéome) * Déployer et assurer la maintenance de services bioinformatiques en ligne sur différentes plateformes (cluster local, cloud, serveurs web) * Assurer une veille technologique sur les bonnes pratiques de développement et sur les méthodologies pertinentes pour les équipes d'accueil * Diffuser et valoriser des savoir-faire bioinformatiques dans l'I2BC via une participation aux activités de la plateforme de bioinformatique de l'unité (20% du service) * Conseiller et former aux techniques et outils développés * Encadrer des stagiaires de niveau L2 à M2 (un à deux par an) * Recueil, analyse et traitement des données Profil recherché: Connaissances, savoirs : * Connaissance approfondie des outils et concepts utilisés en bioinformatique des génomes (génome/transcriptome/protéome) * Recueil, analyse et traitement des données (connaissance approfondie) * Biologie (connaissance générale) * Master en bioinformatique * Anglais niveau B1 Savoir-faire : * Maîtrise des langages Python et R * Maîtrise d'au moins un gestionnaire de workflow (Nextflow et/ou Snakemake) * Expérience en production de conteneurs Linux (Docker, Singularity/Apptainer) * Bonne pratique de la maintenance de code et de la gestion de versions (git, github/gitlab) * Connaissance approfondie des bases de données de séquences, de l'analyse des données NGS et de l'analyse de réseaux biologiques * Maîtrise de la conception et la maintenance en Base de Données relationnelles (PostgreSQL) Savoir-être : * Sens du relationnel et de la communication * Curiosité scientifique et technique, dynamisme * Capacité à gérer de nombreuses interactions et à travailler sur des projets variés
- Type de contrat
-
Contrat à durée déterminée - 36 Mois
Contrat travail - Salaire
- 30 - 40 k€ brut annuel
Profil souhaité
Expérience
- Débutant accepté
Informations complémentaires
- Qualification : Cadre
- Secteur d'activité : Enseignement supérieur
Employeur
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