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Ingénieur Bioinformatique F/H (H/F) 75 - PARIS 12
Offre n° 4754169
Ingénieur Bioinformatique F/H (H/F)
75 - PARIS 12 - Localiser avec Mappy
Actualisé le 26 septembre 2024
La Direction des Services Numériques (DSN) de l'AP-HP fournit des services numériques aux patients et aux professionnels, dont le dossier patient, des systèmes pour la biologie et l'imagerie. Elle fournit également des services pour la réutilisation secondaire des données de santé, au service du pilotage, de la recherche et de l'innovation, au travers de l'EDS. A l'AP-HP, le site hospitalier de la Pitie´ Salpe^trie`re assure une activité de biologie médicale 24h/24 et 7 jours sur 7. L'activité´ de biologie est organisée dans 10 services ou structures internes au département médico-universitaire BioGem, parmis lesquels l'unité fonctionnelle de génomique du développement du département de génétique médicale. Dans le cadre de ses activités de médecine génomique, le département de génétique médicale héberge des compétences en bioinformatique, et travaille également en étroite collaboration avec MOABI, la plateforme de bioinformatique de l'APHP. Au sein du pôle Innovation et Données de la DSN de l'AP-HP, la plateforme de bioinformatique MOABI a pour missions la centralisation progressive du stockage des données de génomique produites au niveau de 39 hôpitaux, leur analyse dans le cadre de processus maitrisés et normalisés, la mise à disposition d'outils d'exploitation des résultats, l'animation d'une communauté bioinformatique de l'AP-HP regroupant plusieurs dizaines d'ingénieurs, le support technique et scientifique, la formation et la veille technologique en bioinformatique. Afin de soutenir plus particulièrement les innovations portées par le département de génétique médicale, tout en renforçant ses activités bioinformatiques transversales de la plateforme MOABI, nous recherchons un.e ingénieur.e en bioinformatique, afin de prendre en charge le développement et la mise en place de pipeline d'analyse de données, et en particulier : - Pipeline d'analyse de données d'exome - Pipeline d'analyse de données de transcriptome - Participer au développement de pipeline d'analyse de données Nanopore Diplôme : Ingénieur(e) A+ et/ou PhD et/ou MD (Bioinformatique, Mathématiques, Biostatistique, Informatique) (bac+5) Niveau d'expérience : profil junior accepté Compétences : - Excellente connaissance des langages Python et Bash - Excellente connaissance de snakemake - Excellente connaissance de docker - Maîtrise de l'environnement Linux/Unix, idéalement distribution Debian Savoir-faire et savoir être : - Excellentes qualités relationnelles et organisationnelles - Excellent esprit d'équipe et sens relationnel - Excellentes qualités de communication - Autonomie, rigueur, méthode - Capacité de travail très importante, associée à un fort dynamisme. - Curiosité et capacité d'adaptation et d'anticipation - Fort intérêt pour le domaine des sciences biologiques et/ou médicales. - Adhésion aux valeurs du service public et intérêt prononcé pour le domaine de la santé - Adhésion aux valeurs de partage de connaissances et de compétences
- Type de contrat
-
Contrat à durée indéterminée
Contrat travail - Salaire
- Salaire brut : Annuel de 40000,00 Euros à 60000,00 Euros
- /
Profil souhaité
Expérience
- Débutant accepté
Informations complémentaires
- Secteur d'activité : Activités hospitalières
Entreprise
Siège de l'AP-HP
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