Mission : Responsable de gestion du flux d'information, de la biocuration en immunogénétique ainsi que de la qualité. Maintenance d'outils et transfert de technologie du laboratoire en startup/deeptech Activités : Activité 1 : o Gestion du flux d'information des données, traitement informatique et expertise biologique des séquences nucléotidiques en immunogénétique pour le système d'information IMGT. o Réceptionner les données des séquences nucléotidiques des immunoglobulines et des récepteurs des cellules T o Utiliser des scripts et des procédures stockées en Java, Python, Rust et en PHP Activité 2 : o Interroger les bases de données avec des requêtes SQL. o Intégrer les données dans la base de données LIGM-DB o Distribuer les données à analyser aux collègues en biocuration o Contrôler la qualité des données avant intégration dans les bases de données. o Adaptation aux nouvelles architectures et technologies mis en place par le service informatique de l'équipe. o Collaborer avec le service bioinformatique dans les études de conception et d'évolution des outils et bases de données du système de la modélisation jusqu'à validation finale. o Rédiger la documentation du pipeline et workflow des différentes procédures appliquées. Activité 3 : o Concevoir, analyse, maintien, évolution et test des outils de la biocuration. o Rediger et mettre à niveau les documentations techniques et fonctionnelles. o Modeliser, concevoir et/ou paramétrer tout ou partie de la solution logicielle o Developper et tester les objets et composants, les logiciels. o Assurer la maintenance évolutive et curative des développements réalisés o Elaborer la stratégie de test, concevoir, spécifier et exécuter des tests fonctionnels et/ou techniques o Creer et tester les packages applicatifs et les scripts de déploiement en production o Réceptionner, installer, documenter, mettre à disposition les packages en assurant le suivi des versions Activité 4 : o Contribuer à la mise en place du système de management qualité selon les normes ISO 9001 et NFX-50-00 o Piloter le processus Infrastructure qualité du laboratoire. o Participer à la gestion du parc informatique et à la résolution des incidents. o Organiser les réunions des différents processus mis en place dans le cadre de la démarche qualité. o Mettre en place des indicateurs en relation avec la stratégie scientifique et politique du laboratoire et les suivre. Activité 5 : o Maintenir, gérer et améliorer les bases de données de l'IMGT. o Participer à la gestion des infrastructures et au déploiement des logiciels. o Participation à l'administration des serveurs, à la gestion des données et des permissions. Activité 6 : o Accroître la visibilité des projets de la biocuration. o Présenter les travaux de biocuration en interne et en externe en réalisant des posters, rédigeant des résumés pour les congrès nationaux et internationaux de biocuration. o Présenter et valoriser l'image, l'expertise, les logiciels et les bases de données IMGT. Activité 7 : o Encadrer les nouveaux arrivants : les former à la méthodologie de la biocuration, les accompagner tout au long de la réalisation de leurs projets au sein du laboratoire. o Contrôler tous les projets Recherche et Développement du laboratoire avant la publication des résultats sur le site d'IMGT. o Prendre en charge des projets d'annotations, gestion de projet, estimer les échéances, planifier et suivre les avancements des projets. o Rechercher et intégrer les séquences d'intérêts des nouveaux génomes dans les bases de données et outils d'IMGT. o Expertise biologique et bioinformatique de ces séquences : Rechercher, Comparer, Identifier et Décrire les gènes dans ces séquences o Etablir la nomenclature des gènes selon les concepts d'IMGT-ONTOLOGY : Elaborer des règles et standards pour enrichir les concepts de standardisation d'IMGT-ONTOLOGY o Rédiger et mettre à niveau les procédures et documentations technique et fonctionnelle pour les biocurateurs. o Synthétiser les résultats, les publier sous forme de pages web en HTML dans IMGT répertoire, utiliser des scripts en PHP. o Gérer les incidents et apporter des corrections aux logiciels utilisés en biocuration. o Inventorier les séquences exprimées d'ADNc. o Utiliser l'outil IMGT/Automat pour l'annotation des cDNA o Enrichir les bases de données et outils en conséquence.