POSTE : Alternance - Master en Microbiologie - Biologie Moléculaire H/F DESCRIPTION : Date limite de candidature : 16/05/2025. Qui sommes-nous ? L'Ifremer, établissement public à caractère industriel et commercial (EPIC), est l'institut français de référence en matière de sciences et technologies marines. Avec plus de 1500 collaborateurs et un budget annuel de 240 M€, l'Ifremer oeuvre à mieux comprendre les écosystèmes marins, évaluer les impacts des activités humaines sur l'océan et innover pour un usage durable de ses ressources. Notre mission repose sur trois piliers : - La recherche scientifique (océanographie, pêche durable, aquaculture, géosciences, etc.) - L'expertise pour les politiques publiques (évaluation de stocks halieutiques, sécurité sanitaire, etc.) - L'innovation pour répondre aux défis environnementaux. - Rejoindre l'Ifremer, c'est contribuer à un océan mieux compris, mieux protégé, et allié du bien-vivre sur la planète. L'Institut et la structure d'accueil : - Département : Ressources Biologiques et Environnement - Unité : MASAE (Microbiologie, Aliment, Santé, Environnement) - Laboratoire : EM3B (Écosystèmes Microbiens et Molécules Marines pour les Biotechnologies) L'unité MASAE s'intéresse aux écosystèmes microbiens et aux microorganismes marins (virus et bactéries) à travers trois axes : - Dynamique des écosystèmes microbiens littoraux ou associés aux produits de la mer - Impact des écosystèmes microbiens sur la qualité et la sécurité sanitaire des aliments d'origine marine - Valorisation des bactéries marines dans les secteurs de l'agro-alimentaire, de la santé humaine et du bien-être Au sein du laboratoire EM3B (environ 20 personnes), l'alternant.e participera aux travaux de recherche sur les microbiotes de produits de la mer et sur le développement de stratégies naturelles de biopréservation. Quelle sera votre mission ? Sous la responsabilité de la responsable du laboratoire EM3B et encadré.e scientifiquement par Delphine Passerini, vous contribuerez à l'étude des communautés bactériennes des produits de la mer et au développement d'outils moléculaires pour mieux comprendre et utiliser ces microbiotes. Vos missions principales : - Participer aux expérimentations de microbiologie et de biologie moléculaire pour l'étude du microbiote des produits de la mer. - Assurer la qualification, le traitement et l'exploitation des données issues de ces analyses. Vos activités quotidiennes : - Réaliser des challenges-tests en microbiologie classique en présence de bactéries pathogènes - Suivre la dynamique des microbiotes d'échantillons par : - Extraction d'ADN - Séquençage de type metabarcoding 16S - QPCR - Traiter les données de séquençage à l'aide de pipelines bioinformatiques disponibles à l'Ifremer - Développer des outils moléculaires (construction de souches recombinantes, expression de gènes rapporteurs fluorescents, délétion de gènes) - Rédiger des protocoles et des comptes rendus Environnement relationnel : En interne : Collaboration étroite avec les membres du laboratoire EM3B, de l'unité MASAE et du service de bioinformatique SeBiMer. En externe : Interactions possibles avec des partenaires selon les projets en cours. Conditions de travail : Type de contrat : Contrat en alternance (apprentissage) Zone de déplacement : Pas de déplacement Télétravail : Pas de télétravail Poste basé à : Nantes (Ifremer - Centre Atlantique) Avantages : 12 jours de RTT et congés supplémentaires Politique RSE active (forfait mobilité durable, etc.) Comment postuler ? Le dossier de candidature doit comprendre (en fichiers PDF séparés, jusqu'à 2 Mo par fichier) : Un CV Une lettre de motivation Date limite de dépôt des candidatures : 16/05/2025 Quelles sont les prochaines étapes ? Étude des candidatures Entretien de pré-qualification Entretien final PROFIL : Formation : Vous préparez un Master en alternance en Microbiologie et/ou Biologie Moléculaire. Compétences techniques : - Biologie moléculaire : extraction d'ADN/ARN, PCR, qPCR, RT-qPCR, metabarcoding, clonage, transformation bactérienne, électroporation - Microbiologie : culture bactérienne, gestion des souches et ressources génétiques (LIMS - Labcollector) - Bioanalyse : utilisation d'outils bioinformatiques pour l'analyse et la comparaison de séquences, réalisation d'arbres phylogénétiques - Rédaction scientifique et tenue d'un cahier de laboratoire électronique ~