Descriptif du poste: Activités principales : Dans le cadre du projet intitulé « REBONDIR » retenu au titre de l'AMI FEDER / INTERREG VI 2023 financé par le PO FEDER / INTERREG 2021/2027 vous êtes recruté(e) au sein de l'unité PVBMT pour une période de 24 mois en tant qu'ingénieur de recherche pour venir en appui technique et scientifique au projet sous la responsabilité de Mme Isabelle Fock-Bastide porteur du projet. Dans ce cadre vous serez affecté(e) aux tâches et actions suivantes : Action 1 " Etude des patrons de diversité génétique chez trois plantes indigènes à la Réunion" Vous contribuerez à l'Action 1 en vous attachant à réaliser les tâches suivantes : - Assemblage de génome de reference (séquençage PacBio) et annotation - Assemblage de données GBS de trois espèces et alignement sur les génomes de référence - Appel de variants (SNP, Indels) - Calcul d'indicateurs synthétiques de la diversité génétique - Identification des principaux groups génétiques et étude des flux de genes entre populations - Etude des facteurs (géographique, climatique.) expliquant l'isolement reproducteur des populations - Comparaison des résultats entre populations naturelles et anthropisées De manière prévisionnelle, vous devrez affecter votre temps de travail à 40 % à la réalisation de cette action 1. Au terme de votre mission vous devrez restituer vos travaux auprès de Mme Isabelle Fock-Bastide porteur du projet sous la forme d'une publication scientifique. Des rapports intermédiaires seront produits tous les 3 mois. Action 2 "Adaptation locale et prévision de la vulnérabilité génomique des populations face au changement climatique" Vous contribuerez à l'Action 2 en vous attachant à réaliser les tâches suivantes : - Détection des régions génomiques sous sélection par des méthodes sans a priori (scan génomique, FST-outliers.) et des méthodes de GWAS / génomique fonctionnelle - Représentation spatiale de la variabilité des fréquences alléliques pour les marqueurs sous sélection - Interprétation des résultats - Validation fonctionnelle - Prévision de la vulnérabilité des populations face au changement climatique, via des analyses statistiques et spatiales De manière prévisionnelle votre temps de travail sera affecté à 50 % à la réalisation de cette action 2 Au terme de votre mission vous devrez restituer vos travaux auprès de Mme Isabelle Fock-Bastide porteur du projet sous la forme d'une publication scientifique. Des rapports intermédiaires seront produits tous les 3 mois. Profil recherché: Action 3 "Communication et transfert" : Vous contribuerez à l'Action 3 en vous attachant à réaliser les tâches suivantes : Communication de vos résultats lors de séminaires (internes et externes) et lors des réunions de travail Participation à la médiation scientifique de vos travaux via les sites institutionnels et les réseaux sociaux Participation à un congrès d'envergure régionale, nationale ou internationale Ecriture d'un rapport sur le déploiement raisonné du germoplasme des trois espèces étudiées, à destination des gestionnaires de la biodiversité De manière prévisionnelle vous devrez votre temps de travail sera affecté à 10 % à la réalisation de cette action 3. Au terme du votre mission vous devrez restituer vos travaux auprès de Mme Isabelle Fock-Bastide porteur du projet sous la forme d'un rapport. Dans le cadre de vos travaux vous serez amené à participer à certains déplacements professionnels comme : la participation à des collectes d'échantillons en forêt la participation à des séminaires et congrès sur le territoire régional, national ou à l'international Conditions particulières d'exercice : Au titre de votre mission au sein du projet « REBONDIR » vous devrez obligatoirement rendre compte de vos activités mensuellement auprès du porteur de projet au moyen de l'application SINCHRO. Vous devrez consacrer 100% de votre quotité de travail au projet subventionné. En cas de variation importante de votre temps de travail au regard de la prévision sus-mentionnée vous devrez en avertir rapidement votre référent hiérarchique et le porteur de projet. Vous devrez respecter strictement la confidentialité des travaux auxquels vous contribuerez ou serez amenés à connaître au sein de l'unité. Pour mener à bien votre mission vous pourrez accéder aux équipements du laboratoire suivant : Pôle de Protection des Plantes,97410 Saint-Pierre, La Réunion (France) Station de recherche forestière de Mare Longue Ordinateur portable - Bases de données Encadrement : Oui Nb agents encadrés par catégorie : 1 ASI Conduite de projet : Oui Compétences*Connaissance, savoir : Connaissances scientifiques théoriques approfondies dans les domaines de spécialité (niveau doctorat) Connaissances approfondies des méthodes et techniques utilisées dans le domain