Descriptif du poste: Dans le cadre du renforcement des activités du Département des Sciences Analytiques, nous recherchons un(e) Consultant(e) expert(e) en Bio-Informatique pour apporter un soutien technique et méthodologique sur l'analyse de données génomiques, la validation des méthodes et la mise en place d'infrastructures de calcul.   Votre Mission : Stratégie, Pipelines et Support Opérationnel   Vous agirez en tant que référent(e) bio-informatique et interviendrez sur l'ensemble du cycle de vie des données, depuis la stratégie d'analyse jusqu'à la libération des lots GMP.   I. Conception et Mise en Place d'Outils   * Infrastructures Cloud : Participer activement à la mise en place d'une plateforme de stockage et de calcul (Cloud Computing) pour les pipelines d'analyse bio-informatiques. * Développement de Pipelines : Mettre en place des pipelines d'analyses bio-informatiques standardisés (sous Snakemake) pour l'analyse des données de séquençage HTS (Illumina et Oxford Nanopore). * Stratégie d'Analyse : Participer à la définition des stratégies d'analyse, au criblage et à l'évaluation des différents outils d'analyse sur des jeux de données existants.   II. Support Opérationnel et Conformité   * Analyse de Données : Réaliser l'agrégation de pipelines existants pour la détermination de l'identité et le séquençage de plasmides, et l'identification des micro-organismes dans les procédés de fabrication. * Qualification : Participer à la qualification des équipements de séquençage et des méthodes analytiques (rédaction de protocoles, réalisation d'analyses, rapports et analyse de risque). * Analyse de Lots : Assurer l'analyse des lots GMP et non GMP. * Maintenance et Transfert : Assurer la maintenance des pipelines d'analyse existants et leur transfert vers d'autres équipes.   III. Accompagnement et Formation   * Assurer la formation des équipes de techniciens de laboratoire et mettre à jour les instructions d'utilisation (SOPs). * Fournir un accompagnement aux utilisateurs dans l'utilisation et l'interprétation des données. Profil recherché: Profil :  Diplome : Ingénieur / Master  HTS (High-Throughput Sequencing) : Maîtrise des outils de QC, Trimming,   Expérience en Cloud computing et/ou calcul GPU.Analyse Prédictive : Annotation de génome, analyse structurale computationnelle, etc. Maîtrise des environnements Unix/Linux (bash).Scripting/Workflow : Maîtrise d'un langage de scripting (Snakemake, Python, R, Rust, bash...). Connaissance des outils de visualisation (IGV/jBrowse) ou d'analyse (CLCGenomicsWorkbench/Geneious). Langue : Avoir un bon niveau d'anglais . Connaissance de la Génomique bactérienne ou de la transcription des cellules eucaryotes.