POSTE : CDD Ingénieur en Bio-Informatique H/F DESCRIPTION : Date de clôture de réception de candidatures : 18/05/2025 Qui sommes-nous ? Le département IRSI (Infrastructures de Recherche et Systèmes d'Information) est en charge des systèmes d'information - de gestion et de recherche - de l'Ifremer. A ce titre, il assure des services et réalise des projets dans le but de développer, programmer et renouveler l'ensemble des ressources informatiques, matérielles et logicielles, nécessaires : - Au fonctionnement général de l'Institut, à sa communication, interne et externe, et à la sécurité de ses systèmes d'information ; - À la mise en oeuvre des infrastructures de recherche dont l'Institut a la responsabilité ; - À la gestion des données et informations scientifiques que l'Institut acquiert, rassemble, analyse ou diffuse en tant qu'institut national de référence en sciences et technologies marines. Ifremer s'est doté depuis 2010 d'un service de bioinformatique (SeBiMER), positionné au sein du département IRSI, et qui s'appuie notamment sur les ressources de calcul du Pôle de Calcul et de Données pour la Mer. Placé·e sous la responsabilité du chef du service de bio-informatique (SeBiMER), vous viendrez renforcer l'équipe actuellement en place dans un contexte d'intensification des activités de gestion de données. Quelle sera votre mission ? En lien avec les équipes de recherche des sites Ifremer recourant aux services du SeBiMER, vous aurez pour missions principales : - Participer à la gestion FAIR des données de bioinformatique de l'institut - Appliquer le protocole Egide-athENA de gestion de données, conçu par le SeBiMER (pipeline Nextflow) - Participer au support bioinformatique général Quelles seront vos activités ? - Suivi du cycle de vie de la donnée de bioinformatique : - téléchargement depuis les serveurs des prestataires de séquençage, - mise en place des données sur le stockage sécurisé de DATARMOR, - collecte des métadonnées via Egide-athENA (standard EBI-ENA), - échange et support utilisateur·ices pour la saisie des métadonnées, - validation des métadonnées et soumission à l'ENA, - suivi de projet via athENA-manager - Accompagner les équipes de recherche de l'institut dans l'utilisation des ressources bioinformatiques : - en participant au support technique général, - en participant à la rédaction de documentations Comment se déroulera votre activité ? - A temps plein Quels sont nos avantages ? - Nous avons un accord de télétravail et nos collaborateurs bénéficient de 12 RTT (demande possible après 6 mois d'ancienneté) et congés supra légaux. - Nous consacrons un budget conséquent au développement des compétences, par des actions individuelles ou collectives. - Nous sommes engagés dans une politique RSE inspirée des raisons d'être de l'institut (forfait mobilité durable) PROFIL : Qui êtes-vous ? - Vous êtes titulaire d'un Bac +5 en bioinformatique Vous avez les compétences, connaissances et expériences suivantes : - Connaissance du cycle de vie de la donnée de séquençage HTS, - Compétences en programmation (bash et python recommandés), - Connaissance de git/gitlab/github, - Bon niveau d'anglais. Vous avez les qualités suivantes : - Très bonne organisation et autonomie, - Aisance relationnelle, bonne communication et sens du service, - Disponibilité et capacité à travailler en équipe, - Capacité d'analyse, esprit de synthèse