Descriptif du poste: Missions principales 1. Développement de pipelines bio-informatiques . Développer, optimiser et maintenir des workflows analytiques pour l'étude génomique de phages et de bactéries. . Annotation, identification des récepteurs et des systèmes de défense, typage et analyse comparative. 2. Analyse de données et modélisation . Réaliser des analyses statistiques inférentielles sur des jeux de données complexes. . Développer des modèles d'apprentissage automatique (random forest, régression, XGBoost). . Assurer la reproductibilité, la documentation et la traçabilité des analyses. 3. Intégration et gestion des données . Structurer, documenter et contrôler la qualité des jeux de données. . Participer aux rapports scientifiques et à la valorisation des résultats. 4. Interaction avec l'équipe expérimentale . Intégration des données issues de plaques assays et courbes de croissance. . Participation à la conception des méthodes expérimentales. Profil recherché: Formation . Master 2 ou diplôme d'ingénieur en bioinformatique, génomique, biostatistiques, microbiologie computationnelle ou domaine associé. Compétences techniques . Excellente maîtrise de Python et/ou R. . Bonne connaissance de Bash / Linux. . Maîtrise des outils bioinformatiques courants (assemblage, annotation, analyse comparative). . Bases solides en statistiques. . Connaissances en machine learning appréciées. Qualités personnelles . Rigueur, autonomie, organisation. . Curiosité scientifique et esprit critique. . Capacité à travailler en équipe dans un environnement pluridisciplinaire.