Description du poste : L'objectif de ce stage est le développement de méthodes d'analyse de données métagénomiques afin de détecter et de caractériser la présence d'agents biologiques au sein de matrices environnementales complexes. Plus précisément, le (la) stagiaire étudiera des jeux de données déjà existants issus de séquençages long-reads (technologies de type Nanopore, notamment avec le séquenceur MinION). Il (elle) s'appropriera les méthodes d'analyse existantes et en développera de nouvelles. Les méthodes développées au cours de ce stage contribueront au développement continu de la capacité souveraine d'identification biologique. Description du profil : Etudiant en Master 2 en bio-informatique ou en fin d'études d'école d'ingénieurBon relationnel, capacité à travailler en autonomie, curiosité et appétence pour la génomique et la microbiologie, compétences solides en Python Diplôme requis : BAC + 3 ou + 4 Diplôme préparé : Diplôme d'ingénieur ou Master (1 ou 2) Métier et famille de métiers : Biologie, analyse de données, bio-informatique