Mission : Dans le cadre du projet ZOOCAM, la personne recrutée participera aux travaux du WP1 consacrés à la détection et à la caractérisation de virus présents chez différentes espèces de mammifères. Sa mission principale sera de rechercher différentes familles virales à partir d'échantillons fécaux de mammifères déjà collectés sur le terrain, en combinant des approches de biologie moléculaire ciblées et, selon les besoins du projet, des approches de séquençage haut débit et de métagénomique virale. La personne recrutée contribuera à l'ensemble de la chaîne expérimentale, depuis la préparation des échantillons et l'extraction des acides nucléiques jusqu'à la préparation des échantillons pour séquençage et à l'organisation des données produites. Activités : Les activités principales seront les suivantes : - Inventorier, organiser et préparer les échantillons biologiques destinés aux analyses moléculaires. - Réaliser l'extraction d'ADN et d'ARN à partir d'échantillons fécaux de mammifères. - Mettre en œuvre et, si nécessaire, optimiser des protocoles de PCR, RT-PCR et PCR quantitative. - Rechercher différentes familles de virus au moyen d'approches ciblées utilisant des amorces spécifiques ou à spectre large. - Mettre en place les contrôles positifs et négatifs nécessaires à la validation des analyses. - Réaliser les étapes de visualisation, purification et préparation des produits d'amplification. - Préparer les échantillons destinés au séquençage. - Participer à la mise en œuvre d'approches de séquençage haut débit et de métagénomique virale. - Participer, selon les protocoles retenus, aux étapes de préparation de librairies pour séquençage. - Contrôler la qualité et la concentration des acides nucléiques et des préparations destinées au séquençage. - Assurer une traçabilité rigoureuse des échantillons, des manipulations et des résultats. - Saisir, organiser, archiver et documenter les données expérimentales. - Participer à l'analyse préliminaire et à l'interprétation des résultats obtenus en interaction avec les chercheurs impliqués dans le projet. - Contribuer à l'amélioration et à la standardisation des protocoles utilisés dans le WP1. - Respecter les règles de qualité, d'hygiène et de sécurité applicables au laboratoire.