Descriptif du poste:\n\nLes missions du poste s'inscrivent dans le projet EPURE (Etude et Plateforme d'utilisation et de Revalorisation des Eaux usées pour l'irrigation des cultures agricoles en Limagne). EPURE ambitionne de construire un modèle de plateforme R&D multidisciplinaire dédiée à la surveillance et la valorisation des eaux usées du bassin de Clermont Auvergne Métropole. Il s'appuie sur un consortium de laboratoires du site universitaire clermontois couvrant des disciplines variées : microbiologie et génomique microbienne (laboratoires LMGE, M2iSH), biocatalyse et photochimie (ICCF), écotoxicologie (LMGE), écophysiologie végétale (PIAF, GDEC), management durable et sciences humaines et sociales (UMR Territoires et CLERMA).\nLa personne recrutée assurera la gestion opérationnelle du projet et participera en particulier au suivi microbiologique, parasitologique, virologique et toxicologique des eaux et des sédiments issus d'une filière de lagunage des eaux usées destinées à la réutilisation (REUT) agricole dans le secteur de la Limagne.\n ACTIVITES ESSENTIELLES : \n1. Échantillonnage et instrumentation des lagunes. Réaliser l'échantillonnage des eaux et des sédiments. Assurer la logistique et la traçabilité des échantillons. Assurer la gestion de l'instrumentation du site de lagunage (installation, calibration, maintenance des capteurs et équipements de mesure : pH, température, turbidité, DBOeq, DCOeq, COTeq?).\n2. Analyses microbiologiques et toxicologiques. Contribuer aux analyses microbiologiques, parasitologiques et virologiques en participant au développement et à l'adaptation des protocoles analytiques (suivi de la diversité microbienne et des gènes d'antibiorésistance ; analyses virologiques qualitatives et quantitatives. Contribuer aux analyses écotoxicologiques (tests Microtox essentiellement). Contribuer à l'interprétation des résultats : persistance, abattement, risques sanitaires.\n3. Gestion des données et appui. Intégrer les données dans une plateforme de surveillance REUT et participer à la veille réglementaire. Coordonner les bilans, rapports, réunions interdisciplinaires. Participation à la restitution des résultats auprès des acteurs locaux et institutionnels. Conseiller des chercheurs, institutions, entreprises sur des questions scientifiques.\n\nProfil recherché:\n\n COMPETENCES REQUISES : \n Connaissances : \n* \nMicrobiologie environnementale : dynamiques des communautés bactériennes dans les écosystèmes aquatiques ; pathogènes environnementaux (méthodes de détection et quantification) ; risques sanitaires liés à la REUT ; biodégradation et bioremédiation (rôles des microorganismes dans le traitement des eaux usées).\n* \nTraitement des eaux usées et REUT : filières de traitement ; réglementation française, européenne, OMS ; critères de qualité pour la REUT agricole ; risques écotoxicologiques (micropolluants, perturbateurs endocriniens, métaux lourds) ; paramètres physico-chimiques (DCO, DBO?, MES, azote (NH??, NO??), phosphore, pH, oxygène dissous.\n* \nÉchantillonnage et méthodes analytiques : protocoles standardisés (prélèvements d'eau/sédiment (normes ISO 5667, AFNOR ; conservation des échantillons) ; techniques de laboratoire (biologie moléculaire : extraction ADN/ARN (kits commerciaux, protocoles maison), PCR/qPCR ; cultures microbiennes (isolement, identification) ; analyses parasitologiques et virologiques (concentration des virus/parasites à partir d'eaux) détection par PCR digitale (dPCR) ou séquençage ciblé.\n Compétences opérationnelles : \n* \nCoordination des activités terrain ; planification ; réalisation des campagnes d'échantillonnage.\n* \nSuivi logistique (transport, stockage, traçabilité des échantillons, distribution aux laboratoires).\n* \nCoordination des analyses environnementales.\n* \nCentralisation, gestion des données générées par les différents acteurs et reporting (structuration/stockage des données (bases de données, métadonnées) selon les principes FAIR, analyse intégrée des données, rédaction de rapports techniques et scientifiques pour le consortium et les parties prenantes, participation à la valorisation des résultats (publications, conférences, vulgarisation).\n* \nParticipation aux réunions de pilotage du projet.\n* \n(...)\n\n PREREQUIS / FORMATION souhaitée : \n* \nTitulaire au minimum d'un diplôme de niveau 7 (Bac +5 à Bac+8 : master, diplôme d'ingénieur, doctorat).\n* \nExpérience confirmée en gestion de projets environnementaux ou de recherche, idéalement dans le domaine de l'eau ou des eaux usées.\n* \nCompétences avérées en terrain et échantillonnage (maîtrise des protocoles d'échantillonnage (eaux, sédiments, boues) ; expérience en instrumentation de terrain (capteurs) ; connaissance des bonnes pratiques de traçabilité et de conservation des échantillons.\n* \nConnaissance affirmée en microbiologie environnementale