Descriptif du poste:\n\nCDD de projet 13 mois\nDémarrage à compter du 01/11/2026\nCatégorie : A Corps : Ingénieur de recherche \nEmploi ouvert aux agents contractuels uniquement \nRémunération selon grille de la Fonction Publique\nAffectation : Laboratoire de Chémoinformatique - UMR 7140 \n\nMission\n\nDévelopper et appliquer des méthodes de chémoinformatique pour l'analyse et la visualisation de l'espace chimique, l'analyse des relations structure-activité ainsi que la conception, la sélection et la priorisation de chimiothèques, dans le cadre d'un projet de 12 mois mené en étroite collaboration avec un partenaire industriel du secteur pharmaceutique. L'objectif est d'automatiser et de fluidifier ces flux de travail afin qu'ils soient reproductibles, réutilisables et transposables à l'ensemble des projets de découverte de médicaments.\n\nActivités\n\nActivités principales :\n\n- Développer des flux de travail reproductibles pour le traitement, la standardisation, la représentation, la comparaison et l'analyse des structures chimiques et des données associées.\n- Concevoir des visualisations claires, statiques et interactives, des espaces chimiques, des squelettes moléculaires (scaffolds), des séries d'analogues et des paysages de propriétés ou d'activités.\n- Concevoir et évaluer des chimiothèques ciblées et diversifiées : couverture de l'espace chimique, analyse de diversité, sélection de sous-ensembles et priorisation des composés.\n- Implémenter ces méthodes sous forme de paquets Python/RDKit maintenables, d'outils en ligne de commande, de notebooks, d'API ou d'applications légères, en collaboration étroite avec les chémoinformaticiens et les chimistes médicinaux du partenaire industriel.\n\nActivités associées :\n\n- Documenter, tester et maintenir les outils développés afin d'en assurer la réutilisation par le laboratoire et le partenaire.\n- Participer aux réunions d'avancement régulières avec le partenaire industriel et présenter les résultats.\n- Rédiger des rapports scientifiques et, le cas échéant, des publications et communications en congrès.\n- Contribuer à la vie scientifique du laboratoire (séminaires, encadrement ponctuel d'étudiants).\n\nProfil recherché:\n\nConnaissances : \n\n- Doctorat, de préférence en chémoinformatique ou dans un domaine proche (chimie computationnelle, modélisation moléculaire, chimie médicinale).\n- Solide expertise en chémoinformatique : représentation et standardisation des structures chimiques, mesures de similarité, analyse et visualisation de l'espace chimique.\n- Connaissance des approches computationnelles de conception et d'optimisation de chimiothèques.\n- Maîtrise de l'anglais scientifique, à l'écrit comme à l'oral.\n\nCompétences opérationnelles :\n\n- Excellente maîtrise de la programmation Python et expérience pratique de RDKit ou d'une bibliothèque de chémoinformatique équivalente.\n- Capacité à construire des flux de travail reproductibles et des visualisations statiques et interactives de données chimiques.\n- Maîtrise de Bash/Linux, de Git et des pratiques modernes de développement logiciel : tests, packaging, intégration et déploiement continus (CI/CD), conteneurs, API, documentation et développement collaboratif.\n- Une expérience des outils de codage agentiques constituerait un atout.\n\nCompétences comportementales : \n\n- Autonomie, rigueur scientifique et sens de l'organisation.\n- Goût du travail en équipe dans un environnement international et interdisciplinaire.\n- Bonnes qualités de communication et aptitude à dialoguer avec des interlocuteurs académiques et industriels.\n- Discrétion et respect de la confidentialité liée au partenariat industriel.