Mission : Développer un worklow d'analyse de données et structurer l'offre de prestation pour les utilisateurs de la plateforme GEMELI Activités : • Elaborer et déployer un pipeline d'analyse de données métabolomiques intégrant les meilleures pratiques en bio-informatique, pour assurer des résultats précis et reproductibles. Il pourra utiliser les compétences initiales de l'équipe sur le transfert des .raw en .mzXML via proteowizard, mais égalemennt d'utiliser les logiciels MZmine, Workflow4metabolomics ou encore les packages R (Bioconductor, FactoMineR, XCMS, CAMERA, ROPLS …) • Intégrer de nouvelles technologies, c'est à dire adapter et intégrer un logiciel d'étude, Compound Discoverer 3.3 (ThermoFischer Scientific), comme outils d'analyse de données de haute résolution pour améliorer l'identification et l'annotation des features (correspondant à un temps de rétention et rapport m/z donné) • Gérer la formation des utilisateurs du pipeline sur la plateforme : participer à la formation et créer les supports, des utilisateurs de la plateforme GEMELI à l'utilisation du nouveau workflow et fournir un support continu pour garantir une acceptation des pratiques.