POSTE : Bio-Informaticien H/F DESCRIPTION : Dans le cadre d'un accroissement d'activités, nous recherchons un support en bio-informatique qui participera à la définition des stratégies d'analyse, la mise en place des outils et pipelines, la réalisation des analyses, la validation d'analyses, l'accompagnement des utilisateurs et la rédaction des instructions. Les principales activités sont détaillées ci-dessous : - Participer à la mise en place dans un environnement cloud d'une plateforme de stockage des pipelines d'analyse bio-informatiques ainsi que des solutions de calcul computationnel nécessaires au service ; - Mettre en place les pipelines d'analyses bio-informatiques sous Snakemake pour l'analyse des données issues de plateforme HTS (Illumina et Oxford Nanopore) pour une analyse simplifiée par les techniciens de laboratoire ; - Réaliser le criblage et l'évaluation des différents outils d'analyse à partir de jeux de données de séquençage existants ; - Aider dans la gestion des données de séquençage ; - Mettre à jour les instructions d'utilisation des pipelines d'analyse ; - Assurer la formation des équipes de techniciens de laboratoire ; - Participer à la qualification des équipements lié au séquençage et des méthodes analytiques sur la partie bio-informatique (rédaction de protocole, réalisation des analyses, rédaction de rapport et analyse de risque) ; - Assurer l'analyse des lots GMP et non GMP. PROFIL : Vous avez : - Un niveau Bac +5 en Bio-Informatique - Au moins 2 ans d'expérience en Bio-informatique dans l'industrie pharmaceutique (idéalement) Compétences indispensables : - Maîtrise des principaux outils dédiés à l'analyse de données de HTS short-read et long-read (QC, Trimming, De novo Assembling, Mapping, Variant calling, etc.) ; - Analyse prédictive (Annotation de génome, analyse structurale computationnelle, matrice de substitution, etc.) ; - Programmation dans un langage de scripting (Snakemake, Python, R, Rust, bash); - Connaissances en génomique, notamment sur des génomes bactériens et la transcription des cellules eucaryotes.