POSTE : Data Manager - Curateur pour les Taxonomies Génomiques des Souches Bactériennes H/F DESCRIPTION : Dans le cadre de la surveillance épidémiologique des bactéries pathogènes et de l'harmonisation des taxonomies génomiques des souches bactériennes, nous recherchons un data manager, dont le rôle sera de contribuer à la curation des données intégrées à la plateforme de librairies génomiques BIGSdb-Pasteur, et d'aider à les analyser et à valoriser. Missions : Sous la supervision du coordinateur du projet BIGSdb-Pasteur (Pr Sylvain Brisse) et du coordinateur des curateurs (Martin Rethoret-Pasty) et en interaction avec la plateforme de Data Management (Anne-Caroline Deletoille), le Data Manager sera responsable des tâches suivantes : - Curation des données : interaction par e-mail (en anglais) avec les fournisseurs de données, contrôles de qualité, intégration des données. - Échange de données avec d'autres plateformes d'épidémiologie génomique telles que pathogenwatch et PubMLST (Oxford). - Mise à jour et harmonisation des données des champs qui le nécessitent ; - Tests de nouvelles fonctionnalités de la plateforme BIGSdb ; - Participation à la mise à jour des procédures de gestion des données et à l'élaboration de lignes directrices sur les meilleures pratiques. - Contrôles la littérature scientifique pour les isolats importés dans la base de données. - Contributions éventuelles à l'analyse et à la dissémination (publications, mailings) des taxonomies génomiques hébergées dans BIGSdb-Pasteur. Contrat en CDD (12 mois) PROFIL : Qualification minimale : Master, ingénieur ou expérience équivalente, avec des compétences en gestion de données et en bio-informatique - Connaissance des langages de programmation (Python et bash) et des systèmes de base de données - Compétences dans le traitement de grands jeux de données (scripting ou automatisation) - Capacité à travailler en équipe et à communiquer sur l'avancement des tâches - Capacité à communiquer, à échanger avec des collègues en microbiologie et en santé publique à l'international - A l'aise dans un environnement international et multiculturel - Idéalement, déjà familiarisé avec le vocabulaire de l'épidémiologie génomique - Une expérience préalable n'est pas requise. Vos conditions et environnement de travail : - Forfait mobilité douce ou remboursement de 75% des titres de transport - Cantine d'entreprise, restaurants, cafétérias - Mutuelle familiale (gratuité conjoints/enfants) et service de santé pour les collaborateurs sur le campus - Salles de sports, 30 activités culturelles/artistiques/sportives sur le campus - Engagements RSE forts, et initiatives des collaborateurs encouragées - Environnement multiculturel (plus de 75 nationalités sur le campus)