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Ingénieur d'études en bioinformatique (H/F) 67 - STRASBOURG
Offre n° 176SGSN
Ingénieur d'études en bioinformatique (H/F)
67 - STRASBOURG - Localiser avec Mappy
Actualisé le 21 juin 2024
Missions L'agent recruté contribuera à remplir les objectifs de notre équipe en termes d'analyses bioinformatiques de données de séquençage de nouvelle génération. Activités L'agent sera responsable de la réalisation d'analyses bioinformatiques de données de séquençage de nouvelle génération portant sur l'expression des gènes (3'RNA-Seq). Ceci impliquera notamment : 1) la réalisation de contrôles qualités des lectures et leur alignement sur le génome murin de référence, 2) pour le RNA-Seq : la quantification de l'expression des gènes et l'analyse d'expression différentielle ; Dans un second temps, l'agent sera également amené à réaliser des analyses intégratives et de biologie des systèmes, qui consisteront à construire des réseaux de co-expression génique (approche MEGENA), puis à annoter ces réseaux et les modules les composant (en utilisant des groupes de gènes définis comme affectés par notre condition biologique d'intérêt, connu pour remplir une fonction biologique commune, enrichis en polymorphismes génétiques associés chez l'homme aux pathologies psychiatriques, etc). Compétences 1) Une expérience préalable dans la recherche en bioinformatique est nécessaire (niveau master). 2) Une expérience préalable dans l'utilisation des langages R ou Python est nécessaire, ainsi que des connaissances en biologie. 3) Une expérience dans les domaines suivants est également souhaitée : traitement et l'analyse de données transcriptomiques ; utilisation d'un centre de calcul et d'un gestionnaire de tâches (par exemple Slurm) ; utilisation d'environnements virtuels (par exemple Conda, venv) ; utilisation de pipelines d'analyses standardisés (par exemple Snakemake). 4) L'agent devra faire preuve d'autonomie et d'organisation. 5) Il sera amené à travailler en équipe avec les personnels du laboratoire impliqués dans ce projet.
- Type de contrat
-
CDD - 6 Mois
Contrat travail - Durée du travail
- 35H
- Salaire
- Salaire brut : Mensuel de 2372.00 Euros sur 12 mois
Profil souhaité
Expérience
- Débutant accepté
Formation
- Bac+5 et plus ou équivalents Cette formation est indispensable
Compétences
- Application web
- Concevoir une application web
- Déterminer des mesures correctives
- Recueillir et analyser les besoins client
- Rédiger un cahier des charges, des spécifications techniques
Informations complémentaires
- Qualification : Technicien
- Secteur d'activité : Recherche-développement en autres sciences physiques et naturelles
Entreprise
![Logo de l'entreprise CNRS MOY1000 ALSACE](https://entreprise.pole-emploi.fr/static/img/logos/e7R0gMURJcRKmNyR5ixZsJsNuHtdvadE.png)
CNRS MOY1000 ALSACE
1000 à 1999 salariés
- Site internet
- http://www.alsace.cnrs.fr/webdel/actus.del
Postuler directement sur le site de l'employeur en copiant ce lien : https://emploi.cnrs.fr/Offres/CDD/UPR3212-PIELUT0-011/Default.aspx
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