Missions : La personne recrutée est rattachée à la Direction Maladies Infectieuses (DMI), au sein d'un binôme dédié aux activités de Santé publique France dans le cadre du projet EMERGEN 2.0. En lien avec les autres épidémiologistes de la DMI, les autres directions de l'agence et les partenaires concernés, elle participera aux activités relatives à la surveillance génomique des maladies infectieuses. Activités : Sous l'autorité du directeur de la DMI et la supervision du coordonnateur de programme « Surveillance Génomique », le chargé d'étude aura pour activités de : - Contribuer aux réflexions stratégiques et travaux à conduire dans le cadre de l'extension progressive des activités du consortium à d'autres pathogènes (échanges avec les CNR concernés, compréhension de leurs besoins et suivi de leurs activités), en intégrant la dimension régionale en collaboration avec la Direction des Régions - Contribuer aux travaux conduits au sein des différents work packages du projet EMRGEN 2.0 necessitant un accompagnement de Santé publique France (WP1 « Structurer et organiser la collecte et l'analyse des échantillons » ; WP2 « Renforcer les ressources et infrastructures bio-informatiques » ; WP3 « Coordonner et assurer la continuité des activités de surveillance et d'analyse épidémiologique » ; WP5 « Organiser et assurer le partage des données de séquençage) - Contribuer aux travaux en lien avec la santé animale et environnementale dans une approche One Health (lien avec les LNR de l'Anses), incluant le suivi du volet surveillance génomique du projet SUM'EAU en coordination avec la DiRe - Contribuer à la rédaction des livrables du projet EMERGEN 2.0 (bilan scientifique annuel) pour les activités relevant du périmètre de Santé publique France. - Appuyer les cellules régionales de Santé publique France dans le cadre de l'investigation des signaux, l'animation des réseaux de laboratoires, la rétro-information des partenaires régionaux et toute autre activité en lien avec la surveillance génomique, en lien avec le référent « Maladies Infectieuses » de la Direction des Régions - Contribuer à la conduite d'études épidémiologiques et d'investigations selon les besoins - Conduire des activités de rétroinformation au sein de l'Agence et en externe, valorisation des activités du consortium via des publications/communications, contribution aux réponse aux partenaires nationaux et internationaux, tutelles et médias - Contribuer aux liens avec l'ECDC et autres partenaires internationaux (HERA, projets européens, OMS) sur le thème de la surveillance génomique. Profil recherché : - Bac+3 à Bac+5 - Master 2 en santé publique, épidémiologie ou microbiologie ou équivalent - Expérience professionnelle souhaitée dans une structure d'épidémiologie ou de santé publique. - Connaissances en épidémiologie des maladies infectieuses et/ou biologie médicale - Maîtrise des outils d'analyse statistiques (R) - Connaissance du système de santé publique français Type de contrat : CDD du 01/10/25 au 31/07/27 (22 mois). Adresser les candidatures : lettre de motivation + CV