Mission : Mission principale La personne recrutée conduira des recherches en biologie computationnelle et bioinformatique, en étroite interaction avec des biologistes expérimentaux, afin d'analyser et d'intégrer des données single cell, multi omics et spatiales, et de développer des modèles permettant de décrypter la régulation génique médiée par les éléments rétrotransposables. Activités : • Analyse de données single cell multi omics (scRNA seq, scATAC seq, multiome) issues de cellules immunitaires et cérébrales. • Intégration de données de transcriptomique spatiale et d'imagerie avec des atlas single cell. • Analyses à l'échelle d'atlas et intégration de cohortes publiques et internes. • Développement de modèles statistiques et d'apprentissage profond pour l'étude de la régulation génomique et des éléments transposables. • Développement, optimisation et maintenance de pipelines reproductibles (R, Python, Nextflow/Snakemake). • Contribution à la rédaction d'articles scientifiques et à la valorisation des résultats.