Date de clôture de réception de candidatures : 10/03/2025 L'unité Ifremer intégrée dans l'UMR MARBEC (https://umr-marbec.fr) mène des travaux de recherche sur la biodiversité marine, ses usages et sa conservation, plus particulièrement en écologie halieutique et en aquacultures durables. Dans ce cadre, l'équipe du Laboratoire Évolution et Génétique des Populations Marines (LEGPM) est spécialisée dans les approches génomiques pour décrire la diversité et l'évolution des populations / espèces / écosystèmes et développe des activités de recherche selon deux axes :(i) la compréhension et la prédiction de l'évolution darwinienne des biocénoses marines naturelles ou exploitées et des services écosystémiques associés, notamment en réponse aux différentes facettes du changement global, et (ii) l'utilisation des outils génétiques et génomiques pour l'étude de l'écologie des populations et des communautés marines. Située sur deux sites (Montpellier et Sète), l'équipe du LEGPM a accès, à de nombreuses plateformes de biologie moléculaire incluant un laboratoire spécialisé dans l'analyse de l'ADNenvironnemental et au serveur de calcul Ifremer DATARMOR. Sous la responsabilité hiérarchique du Responsable d'Unité (Marbec) et du Responsable de laboratoire (LEGPM), vous travaillerez sous la responsabilité scientifique de la cheffe de projet Sophie Arnaud-Haond sur la production et l'analyse de données de génomique des populations de phanérogames et des communautés associées échantillonnés durant la campagne TREC (https://www.embl.org/about/info/trec/) et analysés dans le cadre du projet Biocean5D (https://biocean5d.org). Missions principales  Vous aurez pour mission d'évaluer les relations entre diversité de l'holobionte à la base des prairies de phanérogames, et des communautés benthiques procaryotes et eucaryotes associées. Ce travail repose sur l'analyse de données issues de génomes complets de la phanérogame Zostera marina, et de métabarcode des communautés bactériennes associées, ainsi que des communautés benthiques du sédiment. Vous réaliserez des analyses de génomique des populations sur les génomes de zostère collectés le long des côtes Européennes, afin i) d'établir leurs niveaux de diversité clonale et génétique et leur différentiation intra et inter régionale ii) d'explorer les relations de diversité au sein de l'holobionte (diversités et identités clonales et génétiques, et communautés bactériennes associées) et iii) les relations entre diversités de l'holobionte et des communautés benthiques associées caractérisées par métabarcode du sédiment.  Activités principales  - Assemblage de génomes  - Analyses de génomique des populations - Analyses biostatistiques de diversité des génomes et des communautés associées - Rédaction d'articles scientifiques DOCTORAT (obtenu depuis 3 ans maximum) en écologie évolutive et/ou génomique des populations, Expérience préalable en assemblage et analyse de génomes complets.  Compétences techniques / métiers(Savoirs, savoirs faire) - Solides connaissances en génomique des populations et en biostatistiques - Expérience en analyse bioinformatique de génomes - Sens de l'organisation. - Anglais parlé et écrit  Qualités personnelles(Savoir-être) - Autonomie - Sens du travail en équipe Taux d'activité 100%