Acteur majeur de la recherche publique, INRAE (Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement) vous propose de participer à son aventure scientifique en exerçant vos compétences au sein de nos équipes de recherche ou de nos collectifs en charge de la gestion et du bon fonctionnement de l'institut et de ses installations. Cette offre d'emploi est à pourvoir par voie de concours. Environnement de travail et missions¿: Vous intégrerez l'équipe Ecologie et Génétique des interactions Plantes-Microbiotes-Bioagresseurs (PMB) au sein de l'Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (UMR IGEPP) du centre INRAE Bretagne-Normandie sur le site de Le Rheu. Les objectifs de l'équipe PMB sont de produire des connaissances sur (i) la diversité taxonomique et fonctionnelle des communautés d'organismes associées aux racines des plantes (microbiotes (bactéries, champignons, protistes) et nématodes), (ii) les bases fonctionnelles des interactions entre plantes-microbiotes et différents bioagresseurs racinaires et (iii) les bases génétiques et d'adaptation des interactions plante-microbiotes-bioagresseurs. Sous la responsabilité directe d'un chargé de recherche et dans le cadre de projets en cours vous participerez à la mise en place de méthode de validation fonctionnelle des gènes microbiens impactant la santé des plantes. Vous aurez en charge les activités de génétique microbienne et d'écologie moléculaire concernant à la fois les études de diversité microbienne (fonctionnelle et taxonomique) et d'analyse fonctionnelle du microbiote associé aux plantes. Vous serez amené à participer à l'identification et la validation de gènes microbiens impliqués dans les interactions au sein du microbiote (interactions microbe-microbe) et au sein des interactions plante-microbiote-bioagresseur. Ces études seront réalisées sur des souches candidates et des communautés microbiennes simplifiées (communautés synthétiques); elles impliqueront un travail en lien étroit avec plusieurs scientifiques de l'équipe. Vous aurez en charge de mettre en oeuvre les analyses moléculaires des communautés microbiennes (bactéries et champignons) issues d'expérimentations en laboratoire ou d'origine naturelle issues d'expérimentations aux champs. Il s'agira plus précisément de s'impliquer et mettre en oeuvre les techniques suivantes : Dans le cadre de l'identification et validation de gènes microbiens: - réaliser des constructions dans différents vecteurs et de la mutagénèse ciblée sur des gènes préalablement identifiés, - gérer les collections de souches mutées et de vecteurs, - prendre en charge la caractérisation phénotypique et génomique des souches mutantes, - suivre les évolutions techniques en lien avec les approches de mutagénèse ciblée et aléatoire des microorganismes (bactéries et champignons), - participer au développement de nouveaux protocoles d'édition de génomes microbiens (librairies de mutants transposon, adaptation de CRIPSR-CAS9), - participer, à l'échelle de l'unité, à l'organisation collective des laboratoires de biologie moléculaire et de microbiologie Dans le cadre des études de diversité microbienne taxonomique et fonctionnelle : - extraction et purification d'acides nucléiques (ADN/ARN) de souches et d'environnements complexes, - préparation de librairies pour le séquençage massif (déplétions / soustractions, PCR, purification, multiplexages, contrôles qualités) d'ADN / ARN, - quantification de l'abondance des communautés, populations ou gènes d'intérêts par qPCR et RT-qPCR, - élargissement à court terme à la préparation et mise en oeuvre de séquençage de génomes bactériens complets Formation et compétences recherchées¿: Baccalauréat, BP, BT - Formation souhaitée: Génétique microbienne, microbiologie et biologie moléculaire moyen débit appliquée aux microorganismes. Techniques de génétique fonctionnelle chez les bactéries et champignons : clonage et mutagénèse ciblée ou aléatoire de gènes microbiens, extraction Contact : Nathan VANNIER /02 23 48 5163 Postuler : Vous avez jusqu'au 20 mars 2025 pour vous inscrire sur le site INRAE Jobs TR25-SPE-5 Type d'emploi : Temps plein, CDI Rémunération : 2¿171,00€ à 2¿341,00€ par mois Avantages : * Restaurant d'entreprise * RTT Lieu du poste : En présentiel