Mission : Le poste s'inscrit dans le projet SuPRTryP, soutenu par le PEPR BBEST, qui combine des approches numériques et expérimentales pour exploiter la diversité des levures et valoriser des co-produits agroalimentaires par fermentation. La personne sera en charge du développement d'un pipeline d'annotation automatique des fonctions enzymatiques de génomes de levures. Ce pipeline s'appuiera sur des pipelines développés par des partenaires de l'IRISA, qu'il faudra adapter au cadre des levures. Le pipeline devra ensuite être enrichi par des méthodes originales de prédiction de fonctions enzymatiques présélectionnées par l'équipe de recherche, dont il faudra s'assurer du passage à l'échelle. Enfin, la personne devra développer une méthode pour interpréter les annotations enzymatiques en voies métaboliques d'intérêt pour le projet scientifique. Le pipeline sera appliqué à une sélection de plusieurs centaines de souches de levures sélectionnées par le consortium du projet. Activités : - Développer un pipeline d'annotation des fonctions enzymatiques de génomes de levures et de leur interprétation en voies métaboliques ciblées. - Réaliser l'annotation structurelle de souches de levure clés pour le projet scientifiques. - Implémenter des algorithmes de prédictions de fonctions enzymatiques issus de l'état de l'art. - Développer un algorithme d'interprétation d'annotations enzymatiques en voies métaboliques. - Annoter fonctionnellement des génomes de levures (plusieurs centaines).